Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ufm1P61961 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ufm1P61961 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ufm1P61961 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms