Protein–RNA interactions for Protein: P56942

Pmch, Pro-MCH, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmchP56942 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PmchP56942 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PmchP56942 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PmchP56942 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PmchP56942 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PmchP56942 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PmchP56942 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PmchP56942 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PmchP56942 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PmchP56942 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PmchP56942 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PmchP56942 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms