Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VdrP48281 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
VdrP48281 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VdrP48281 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VdrP48281 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
VdrP48281 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
VdrP48281 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VdrP48281 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VdrP48281 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VdrP48281 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms