Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACADSBP45954 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACADSBP45954 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms