Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC009656.1-201ENST00000531966 478 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 GIMAP7-201ENST00000313543 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 MGST1-204ENST00000396209 979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC107884.1-203ENST00000530846 628 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXD11P31277 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 ATG10-IT1-201ENST00000396880 487 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD11P31277 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms