Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprmP28828 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PtprmP28828 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprmP28828 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprmP28828 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprmP28828 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PtprmP28828 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PtprmP28828 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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