Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NdnP25233 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NdnP25233 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NdnP25233 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NdnP25233 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NdnP25233 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NdnP25233 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NdnP25233 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NdnP25233 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NdnP25233 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NdnP25233 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NdnP25233 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NdnP25233 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms