Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP5F1P24539 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5F1P24539 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms