Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NfyaP23708 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfyaP23708 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NfyaP23708 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms