Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KitlgP20826 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KitlgP20826 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
KitlgP20826 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KitlgP20826 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms