Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pou4f1P17208 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pou4f1P17208 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms