Protein–RNA interactions for Protein: P16015

Ca3, Carbonic anhydrase 3, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca3P16015 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ca3P16015 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ca3P16015 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ca3P16015 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ca3P16015 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms