Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CALM3P0DP25 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CALM3P0DP25 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CALM3P0DP25 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms