Protein–RNA interactions for Protein: P0DJF2

Pet117, Protein PET117 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pet117P0DJF2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pet117P0DJF2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pet117P0DJF2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pet117P0DJF2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pet117P0DJF2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pet117P0DJF2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pet117P0DJF2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pet117P0DJF2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pet117P0DJF2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pet117P0DJF2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms