Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TtrP07309 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
TtrP07309 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TtrP07309 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
TtrP07309 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
TtrP07309 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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TtrP07309 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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TtrP07309 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
TtrP07309 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
TtrP07309 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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