Protein–RNA interactions for Protein: P06330

Ig heavy chain V region AC38 205.12, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06330 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P06330 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P06330 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P06330 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P06330 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06330 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06330 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06330 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P06330 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P06330 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P06330 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P06330 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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