Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarce1O54941 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarce1O54941 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarce1O54941 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms