Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sema6aO35464 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sema6aO35464 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms