Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnih1O35372 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnih1O35372 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms