Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casq1O09165 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casq1O09165 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casq1O09165 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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