Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20877J3QPZ4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20877J3QPZ4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20877J3QPZ4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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