Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm17577J3QNF7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm17577J3QNF7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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