Protein–RNA interactions for Protein: J3QME2

Gm20914, Predicted gene, 20914, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20914J3QME2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20914J3QME2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20914J3QME2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20914J3QME2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm20914J3QME2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20914J3QME2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm20914J3QME2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20914J3QME2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20914J3QME2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms