Protein–RNA interactions for Protein: G3X9B4

4933408B17Rik, MCG121508, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933408B17RikG3X9B4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933408B17RikG3X9B4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4933408B17RikG3X9B4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms