Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim15G3UY57 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trim15G3UY57 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trim15G3UY57 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms