Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ercc6F8VPZ5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ercc6F8VPZ5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ercc6F8VPZ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Ercc6F8VPZ5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms