Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TrdnE9Q9K5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TrdnE9Q9K5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TrdnE9Q9K5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms