Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms