Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ2

Scgb1b20, ABPA20, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1b20E9PWZ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scgb1b20E9PWZ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scgb1b20E9PWZ2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms