Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim5E9PV98 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim5E9PV98 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms