Protein–RNA interactions for Protein: B0QZW4

Supt3, Suppressor of Ty 3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt3B0QZW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Supt3B0QZW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Supt3B0QZW4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Supt3B0QZW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms