Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TVP23AA6NH52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23AA6NH52 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms