Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fam71e1A1L3C1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Fam71e1A1L3C1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Fam71e1A1L3C1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms