Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K5

R3HDM2, R3H domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM2Q9Y2K5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
R3HDM2Q9Y2K5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
R3HDM2Q9Y2K5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
R3HDM2Q9Y2K5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms