Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNRF3Q9ULT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNRF3Q9ULT6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms