Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmed2Q9R0Q3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Tmed2Q9R0Q3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmed2Q9R0Q3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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