Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ercc4Q9QZD4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ercc4Q9QZD4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ercc4Q9QZD4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms