Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Tmod4Q9JLH8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmod4Q9JLH8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmod4Q9JLH8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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