Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trem3Q9JKE1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trem3Q9JKE1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms