Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH1

Scp2d1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2d1Q9DAH1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scp2d1Q9DAH1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scp2d1Q9DAH1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms