Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sec23bQ9D662 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sec23bQ9D662 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms