Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc83Q9D4V3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc83Q9D4V3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc83Q9D4V3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms