Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
4933428M09RikQ9D3X3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
4933428M09RikQ9D3X3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms