Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc6bQ9D289 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trappc6bQ9D289 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trappc6bQ9D289 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms