Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Xrcc3Q9CXE6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Xrcc3Q9CXE6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms