Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BccipQ9CWI3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BccipQ9CWI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms