Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RTRAFQ9CQE8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RTRAFQ9CQE8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms