Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Med21Q9CQ39 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Med21Q9CQ39 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Med21Q9CQ39 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Med21Q9CQ39 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms