Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cmtm3Q99LJ5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cmtm3Q99LJ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms