Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tmed9Q99KF1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmed9Q99KF1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms